Calibreのログを出力する

Calibreでは，デバッグ用のログファイルを吐き出すことができる．そのためには，環境変数 MGLS_DEBUG_LOG_DIR にログファイルの出力ディレクトリを指定する．
% export MGLS_DEBUG_LOG_DIR=/log

ライセンス関連のログが詳細に記録されるので便利．ただし遅くなるのでデバッグ時のみ有効にするのがよいそうだ．

IC Compilerにて配置配線に失敗する(alo_initial_cluster)

結論：計算機の割り当てられた IP アドレスと /etc/hosts の IP アドレスに不一致がある事を修正する．

IC Compiler にて自動配置 (place_opt) が以下の様に失敗するようになった．

icc_shell> place_opt

(略)

Information: Running stand-alone coarse placer in a separate process using temp directory '/tmp'. (PSYN-605)

Severe Error: Fatal error: Placer did not complete. (PSYN-375)

Error: psynopt has abnormally terminated.  (OPT-100)

Error: place_opt results invalid due to placer failure.

Error: A Severe error has occurred. To ensure that the script does not continue, the value of sh_continue_on_error has been overridden to be false. Your script is being interrupted. To see the Tcl call stack for the part of your script which generated the Severe error use the error_info command.   (CMD-103)

Error: Severe error encountered

Use error_info for more info. (CMD-013)

error_info を確認してみると

icc_shell> error_info

Extended error info:

can't unset "alo_initial_cluster": no such variable

    while executing

"unset alo_initial_cluster"

    invoked from within

"place_opt"

 -- End Extended Error Info

unset alo_initial_cluster を実行できないと言われている．計算機の DHCP 割り当てを変更したばかりだったので，/etc/hosts の修正をしてみたら解決した．おそらく，PCクラスタで実行するためにホスト情報の取得に失敗しているのだろうと推測される．

既視感あるなーって思ったら，過去に SiliconSmart でやらかしていた．まるで成長していない…．

 

Cent OS 7においてJVMのエラーでCalibreをインストールできない

Calibre のインストーラーが Java でできているのだが，解凍したバイナリを実行すると
*** Warning with: ./install
The version of ./JRE/bin/java may not be correct!
...Required: "1.6.0"
...Found: Error: no `server' JVM at `/cad/mentor/CDROM/install.ixl/JRE/lib/i386/server/libjvm.so'.
...Please check that you have correctly installed the Mentor Install program that contains the Java Runtime Environment.
Error: no `server' JVM at `/cad/mentor/CDROM/install.ixl/JRE/lib/i386/server/libjvm.so'.

と表示される．スクリプトを見ると，解凍したバイナリ中で
$ JAVA -version
を実行したときに，バージョン情報では無くて libjvm.so がエラーを吐くようだ．

解決方法は XFS ではなくて他のファイルシステム，例えば ext3 や ext4 を使うとよい．
EBS 12.2 -- problem installing EBS on XFS -- no server JVM at libjvm.so

上記ブログの内容を簡単にまとめると，RHEL7 系ではデフォルトでファイルシステムが XFS で，XFS で 1 TB 以上の容量を取り扱う場合に 64 bit inode を使うのだが，これが 32 bit のJava アプリケーションの実行に問題を発生させるという話．マウント時に 32 bit inode を使うようにしてもよいとのことだ．
自分の環境は Cent OS 7 に 3 TB の SSD を XFS(デフォルト) で作成していたので問題となったようだ．古い 500GB の HDD を ext4 でフォーマット & マウントしたらインストーラーが起動した．

(上記Blogでは Oracle Linux 7 で問題となっていて，自社の OS で自社のインタプリタが動かないってどういうことやねん，という感じ)

Cent OS フォーラムにもトピックが立っていたが，解決しなかった．

Java error during Calibre installation

Cent OS 7 にtgifを入れる．Gnuplotでtgifを出力する．

 Tgif を入れる

$ wget http://bourbon.usc.edu/tgif/ftp/tgif/tgif-QPL-4.2.5.tar.gz

$ tar zxvf tgif-QPL-4.2.5.tar.gz

$ cd tgif-QPL-4.2.5
$ sudo yum install imake libXmu-devel libidn-devel libXt-devel
$ sudo yum install xorg-x11-fonts-ISO8859-1-100dpi.noarch xorg-x11-fonts-ISO8859-1-75dpi.noarch  xorg-x11-fonts-ISO8859-14-100dpi.noarchxorg-x11-fonts-ISO8859-14-75dpi.noarch xorg-x11-fonts-ISO8859-15-100dpi.noarch xorg-x11-fonts-ISO8859-15-75dpi.noarch xorg-x11-fonts-ISO8859-2-100dpi.noarch xorg-x11-fonts-ISO8859-2-75dpi.noarch  xorg-x11-fonts-ISO8859-9-100dpi.noarchxorg-x11-fonts-ISO8859-9-75dpi.noarch
$ ./configure
$ make
$ sudo make install

Gnuplot を SourceForge からダウンロードして解凍

https://sourceforge.net/projects/gnuplot/files/gnuplot/

$ tar zxvf gnuplot-5.4.1.tar.gz

$ cd gnuplot-5.4.1

$ ./configure -with-tgif

$ make

$ sudo make install

 

Gnuplot 5.4では tgif はレガシーだって，トホホ